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幾種常見的限制性內切酶及特性

更新時間:2025-08-21點擊次數:69

DNA 限制性內切酶(簡稱限制酶)是一類能識別并切割雙鏈 DNA 特定核苷酸序列的酶,廣泛應用于基因克隆、分子標記、基因編輯等分子生物學實驗中。以下是一些常見的限制酶及其主要用途:

一、常見的限制性內切酶及特性

幾種常見的限制性內切酶及特性


1. EcoRI

識別序列:5'-GAATTC-3'(切割后產生 5' 粘性末端:-G AATTC-

來源:大腸桿菌(Escherichia coli RY13

用途:

基因克隆中常用的工具酶,用于切割載體和目的基因,產生互補粘性末端以便連接。

構建基因組文庫或 cDNA 文庫時的酶切處理。

2. HindIII

識別序列:5'-AAGCTT-3'(切割后產生 5' 粘性末端:-A AGCTT-

來源:流感嗜血桿菌(Haemophilus influenzae Rd

用途:

EcoRI 類似,常用于載體和目的基因的酶切,構建重組質粒。

用于 DNA 片段的限制性長度多態(tài)性(RFLP)分析,輔助基因定位或親子鑒定。

3. BamHI

識別序列:5'-GGATCC-3'(切割后產生 5' 粘性末端:-G GATCC-

來源:淀粉芽孢桿菌(Bacillus amyloliquefaciens H

用途:

廣泛用于基因克隆中的酶切連接,尤其適用于構建表達載體。

用于 DNA 甲基化分析(部分甲基化位點會抑制其切割活性)。

4. XhoI

識別序列:5'-CTCGAG-3'(切割后產生 5' 粘性末端:-C TCGAG-

來源:潮霉素鏈霉菌(Streptomyces xanthus

用途:

常用于真核表達載體的構建(如與載體上的 XbaI 等酶切位點配合)。

因切割產生的末端與 SalI(識別 GTCGAC)互補,可實現不同酶切片段的連接。

5. PstI

識別序列:5'-CTGCAG-3'(切割后產生 3' 粘性末端:-CTGCA G-

來源:普羅威登斯菌(Providencia stuartii 164

用途:

用于質粒載體的酶切(如 pBR322 的經典酶切位點)。

在基因克隆中,3' 粘性末端可減少自身環(huán)化概率,提高重組效率。


幾種常見的限制性內切酶及特性


6. Sau3A

識別序列:5'-GATC-3'(切割后產生 5' 粘性末端:-G ATC-,與 BamHI 末端互補)

來源:金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus 3A

用途:

因識別 4 堿基序列(切割頻率高),常用于基因組 DNA 的隨機片段化,構建小片段文庫。

可與 BamHI 切割的載體連接(末端互補),增加克隆靈活性。

7. SmaI

識別序列:5'-CCCGGG-3'(切割后產生平末端:-CCC GGG-

來源:粘質沙雷氏菌(Serratia marcescens Sb

用途:

用于產生平末端的 DNA 片段,適用于平末端連接(如不同來源的平末端片段拼接)。

因平末端連接效率較低,常需配合 T4 DNA 連接酶使用。

8. NotI

識別序列:5'-GCGGCCGC-3'(切割后產生 5' 粘性末端:-GCGGCC GC-

來源:諾卡氏菌(Nocardia otitidis-caviarum

用途:

識別 8 堿基序列(切割頻率低),常用于大片段 DNA 的酶切(如人工染色體載體 BAC、YAC 的構建)。

用于保留目的基因完整序列(避免內部被頻繁切割)。


二、限制酶的分類及選擇依據

 

限制酶按切割方式可分為粘性末端酶(如 EcoRIHindIII)和平末端酶(如 SmaI),選擇時需考慮:

目的基因和載體上的酶切位點是否匹配(避免切割目的基因內部)。

末端類型(粘性末端連接效率高于平末端)。

酶切條件(如溫度、緩沖液)是否兼容(多酶切時需選擇通用緩沖液)。

幾種常見的限制性內切酶及特性

三、延伸應用

 

除上述基礎用途外,限制酶還用于:

基因編輯驗證:切割 CRISPR/Cas9 編輯后的 DNA,通過電泳檢測是否成功插入 / 缺失片段。

甲基化分析:部分酶(如 HpaII)對甲基化位點敏感,可用于檢測 DNA 甲基化狀態(tài)。

選擇時需結合實驗需求(如片段大小、連接效率)和酶的特異性,參考供應商提供的酶切位點圖譜和反應條件。


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